科学研究发现，种子在萌芽期具有极强的生命力，并产生多种生物活性因子。中山大学国家教育部食品工程研究中心开创性提出灵芝孢子的“萌动激活理论”，即首先精选鲜活的灵芝孢子，在低温下使其休眠，休眠时间及温度按照质量标准进行严格控制。在适当的休眠期后，进行萌动激活，使灵芝孢子“苏醒”，从而使灵芝孢子由“休眠”的静态提升至“激活”的动态，激发孢子中的灵芝三萜类化合物、生物碱、灵芝甾醇和活性酶等多种活性物质的生物转化并提升至高峰值，生物活性显著提升并达到顶峰。

萌动激活能显著提升灵芝孢子的生理活性，但并非所有的灵芝孢子均能通过萌动而使其活性提高。研究发现，只有新鲜、饱满并具有生命力的灵芝孢子才能通过萌动激活而有效提升其药理活性。灵芝栽培的环境和营养条件对灵芝孢子的品质和活性有重要影响，如用木屑等袋料栽培收获的灵芝孢子个体较小、皱缩、内含物少、活性低，孢子萌发率很低；而用段木培植收获的灵芝孢子个体较大、饱满、活性高、表面光滑，有利于灵芝孢子的萌发，萌发率很高。