酶分子修饰通过对蛋白酶主链的剪接切割和侧链的化学修饰对酶分子进行改造，改造的目的在于改变酶的一些性质，创造出天然酶不具备的某些优良性状，扩大酶的应用已达到较高的经济效益。
通过对酶蛋白分子的主链进行“切割”、“剪切”以及在侧链上进行化学修饰来达到改造酶分子的目的。这种应用化学方法对酶分子施行种种“手术”的技术称为酶化学修饰。
酶分子的化学修饰简单，容易见效。
一般情况下，要求修饰剂具有较大分子量、有良好的水溶性和生物相容性，修饰后酶的半衰期长。
应熟悉酶的分子结构，活性部位，侧链集团。反应活性温度、PH等。
反应要在酶稳定的环境下进行，避免破坏酶的活性集团。控制酶分子与修饰剂的分子比例，反应温度，时长。确保酶的高结合率和高回收率。
酶的基因工程主要利用基因工程解决酶的大量生产和天然酶分子的改造。
在酶的蛋白质基础上利用基因工程将两种或两种以上的酶的不同结构片段构成新的酶，使酶具有多种生产需要的功能特点。