玛曲县藏医院创建于1984年，现为玛曲县唯一的一所民族医院。现开设床位50张。专业技术人员41人，其中高职1人，中级8人。医院科室设置齐全，有完备的基础医疗设施。2003年7月被卫生厅批准为甘肃中医学院藏医教学医院。