镰仓后期，在皇位继承上出现了后深草天皇（持明院统）和龟山、后宇多天皇（大觉寺统）两支皇统的对立。两皇统都想利用幕府的力量达到唯我独尊，结果反受幕府干涉，在幕府的提议下形成了两皇统交替即位的协定。从后宇多天皇到后醍醐天皇的6代天皇为两统交替继位。但两统对立未能消除，后来发展成为南北朝对立的局面。