长湖鲌类国家级水产种质资源保护区总面积14000公顷，其中核心区面积4750公顷，实验区面积9250公顷。核心区特别保护期为4月15日-7月31日。保护区位于湖北省长江中游北岸，江汉平原四湖流域上游，荆州市区东北郊，包括长湖水域及沿湖滩涂、沼泽，范围在东经112°12′03.313″-112°30′44.272″，北纬30°22′01.338″-30°31′47.805″之间，其地理位置边界东至蝴蝶咀、彭冢湖，西至庙湖渔场，南至观音垱镇，北至后港镇。核心区包括马洪台和大湖2块区域。马洪台核心区位于长湖中部区域，面积约1650 公顷，范围在东经112°18′57.068″-112°22′10.651″，北纬30°22′56.648″- 30°25′29.589″之间，其边界线为姜家台-王家台-刘家台-象鼻垱-谭家湾，东以刘家台水域为起点，向西南经象鼻垱，南至谭家湾，后转向西南，西至姜家台，然后转向东北，北至王家台，向东南至刘家台。大湖核心区位于长湖东部的大湖区，面积约3100 公顷，其范围在东经112°25′35.534″-112°30′02.078″，北纬30°24′24.142″-30°27′53.690″之间，其北以瓦屋湾水域经大吴湾至花篮嘴一线为界，东以花篮嘴为起点，向南经后墙湾、窑场街至习口闸，南以习口闸为起点，向西经文岗至胡家垱，西以胡家垱至瓦屋湾一线为界。其边界线为瓦屋湾-大吴湾-花篮嘴-后墙湾-窑场街-习口闸-文岗-胡家垱。主要保护对象为翘嘴鲌、蒙古鲌、青梢鲌、拟尖头鲌、红鳍原鲌等5种鲌类及其生境，其他保护物种包括青鱼、草鱼、鲢、鳙、鳡、鳜、团头鲂、黄颡鱼、刺鳅、龟、鳖、中华绒螯蟹、青虾、河蚌、菱、野菱、莲、茭白等重要经济水生动植物物种。