跨井系统（borehole-borehole system）是井中地球物理的一种工作系统。例如，跨井激发极化法，工作时将供电电极A放入钻孔中某一深度上，供电电极B放在地面无限远处，测量电极则放在相邻的另一钻孔中沿井身进行观测，从而研究两钻孔之间的地质问题。此外，还有声波跨井系统、电磁波跨井系统和电阻率跨井系统等。