江苏省海洋综合开发与生态建设工程中心成立于2008年，以海洋资源环境为主要研究领域，开展海洋调查与研究、海域使用论证、海域使用测量、建设项目环境影响评价、海洋资源评估、海洋规划与区划等方面的工作。下设综合办公室、科研与开发办、业务室、海洋调查监测与数据分析实验室、海洋基础地理实验室、海洋模拟分析实验室等实验室和海洋综合开发论坛。工程中心近期建设规模为50人左右，其中教授级工程技术人员15人，高级工程师20人。

工程中心具有国家海洋局颁发的海域使用论证资质证书（甲级，国海论字第0218号），是江苏省唯一具有此种甲级证书的单位，具有国家海洋局颁发的海域使用测量资质证书（乙级，国海测字第02060号），是国家海洋功能区划专家委员会评选确定的海洋功能区划编制技术单位（第0818号），同时具有国家环境保护总局颁发的建设项目环境影响评价资格证书（国环评证乙字第1920号），可以从事海域使用论证、测量，环境影响评价、环境规划以及相关的海洋区划、开发、管理等工作。

近年来，承担和完成了江苏海域勘界、江苏海洋环境保护与生态建设规划、海域使用分等定级与使用金标准制定、海岛特别保护区选划、江苏908专项“江苏省海域使用现状调查”等六十余项服务于江苏海洋综合开发与管理的调查、研究与技术研发项目以及江苏LNG项目、田湾核电站、南通港洋口港区等项目的海洋环境评价与海域使用论证等七十多项科技咨询项目。