惠州市农科所创办于1952年，至今已有50多年的悠久历史。现有职工总人数120人，其中在职63人，离退休57人。有技术人员21人，其中高级农艺师3人，农艺师7人，助理农艺师8人，技术员4人。有土地面积600亩，其中100亩为科研试验田，4000平方米为科研试验大棚。有办公面积500多平方米，拥有电脑7台，科技资料室200多平方米，科技图书和科技论文、试验总结15万册（份）。有水稻收割机、机耕拖拉机等机械5台；快速农残检测仪和电子分析天平、火焰光度计、电子数粒仪等仪器设备30多台（套）；科技实验室300多平方米，有种子专用仓库800多平方米，种子专用晒场1500平方米。 70年代以前，我所科研试验主要内容有水稻、旱粮、经作、植保、土肥和畜牧等，多项科研成果先后荣获国家、省和市的科学技术奖。在水稻选育种方面，我所曾经有过辉煌的历史，我所培育的早稻良种“青小金早”曾经成为我省乃至我国较早育成的矮秆稻种之一，该品种的推广应用，使当时的惠阳地区水稻亩产达到300多公斤水平，其种植面积遍及江南地区及东南亚等国家。我所育成的晚稻良种“广二选二”曾是惠阳地区长达10多年的大面积当家品种。根据当时各省（区）播种面积最大的一年计算，这两个品种合计推广面积达3300万亩，增产稻谷176万吨，当时社会效益达1.7亿元。

90年代以来，由于种种历史原因，农科所的发展没有很好地跟上我国改革开放的发展大潮，以至农科所科研试验工作近乎停滞，科技队伍青黄不接，科研设备陈旧，科研手段落后。科研队伍由于没有很好地开展继续教育和学习，造成科研队伍的知识老化，整体素质降低，科研能力削弱，干部职工政治思想教育工作几乎中断，党员政治觉悟低，党性不强，干部职工思想意识落后，集体意识淡薄。工作上人浮于事，互相扯皮。科研体制一直停留在计划经济时代的“大锅饭”，干部职工出现“做与不做一个样，做多做少一个样，做好做坏一个样”的状况，科研工作中出现只以研究水稻为主的情况，造成“科研项目单一，科研成果寥寥”局面。

2001年，经省政府批准，农业厅在我所设广东省（惠州）区域性农业试验中心，并于2002年10月正式挂牌，实行两块牌子一套人马。以此为契机，2002年开始，开展了一系列的改革和创新。