黄梅县水利局成立于1950年，是县人民政府的水行政主管部门。局机关共设办公室、政工股、计划财务股、水政水资源股、经济管理股、工程建设管理股等6个职能股室和县防汛抗旱指挥部办公室，下辖15个二级单位和8个流域水利站。其主要职能有：

负责《中华人民共和国水法》、《中华人民共和国水土保持法》、《中华人民共和国防洪法》等法律的组织实施和监督检查；

拟定全县水利工作的方针政策、发展战略和中长期规划，组织起草有关地方性规章并监督实施；

统一管理全县城乡水资源（含空中水、地表水、地下水），组织拟定全县和跨乡镇长期供求计划、水量分配方案并监督实施；

组织有关全县国民经济总体规划、城市规划及重大建设项目的水资源和防洪的论证工作；

实施取水许可制度和水资源费征收制度等。