湖州师范学院水生生物资源养护与开发研究所成立于2012年1月，水生生物资源养护与开发研究所设在该校生命科学学院内，该所主要开展水生动物种质改良技术、水生动物营养调控与饲料学、水生生物资源增殖与评估技术、水产养殖环境管理学与水生生态学以及水生动物病理学、毒理学和药理学等5个方向的研究，同时推动高校科研成果的产业化进程。

该所承担国家自然基金、农业部和浙江省重大科技专项等各类科研项目20余项。根据浙江省以及湖州市渔业产业的发展现状和今后一个阶段对水生生物资源养护与开发的技术需求，该所将致力于充分发挥南太湖流域得水生生物资源优势，结合地方经济的发展，坚持人才培养、科学研究、产业开发“三位一体”。以人才队伍建设和人才培养为根本，通过组建团队、引进人才、添置设备及争取高层次科研项目等，把研究所建设成为立足本省（市）、地方特色明显、国内外具有影响力的研究所并为社会各界提供相关的技术咨询服务。

研究所已着手建立一整套高效的管理和运行机制，将以国家大宗淡水鱼产业技术体系及浙江省渔业科技创新服务平台水生生物学与水环境研发中心等为依托，力争早日取得高水平的原创性重大研究成果。