湖南省微生物研究所系湖南省农业厅管理的事业单位，现有在职职工188人，离退休人员195人。拥有占地3200平方米的科研大楼和151亩的中试基地，自有资产达8000多万元。主要从事环境微生物、生物农药、生物肥料、兽药、饲料添加剂的研发与中试。从建所至今曾获得80余项科研成果，其中获部和省科技进步奖近30项，科技成果的转化推广率达到60%以上，获得了良好的社会效益和经济效益，为全省乃至全国农业发展做出显著贡献。

本所的前身是1956年3月成立的原地方国营湖南细菌肥料厂，1964年1月更名为湖南省微生物研究实验工场，1966年4月更名为长沙市微生物研究所，1973年7月更名为湖南省微生物研究所。