黑龙江省科学院高技术研究院经黑龙江省委、省政府办公厅于2007年6月批准成立。宗旨是充分发挥黑龙江省科学院科技引领作用，搭建稳住和吸引高层次科技人才的平台，推进科技创新，把握未来发展与竞争的主动权。

主要职责和任务：开展新材料、新能源、生命与生物科学、核机电一体化、信息科学、公共安全、交叉科学的应用基础、高技术、重点公益研究，主要从事前沿、核心、关键、共用技术的开发和转化，提升黑龙江省原始创新、集成创新、引进再创新能力。其中生命与生物科学方向的研究工作主要由微生物研究所承担。

黑龙江省科学院高技术研究院隶属黑龙江省科学院，机构规格为正处级，公益一类、省财政全额预算拨款事业单位。人员编制530名。