杭州江南科学研究院成立于2009年7月，由杭州市政府和江南大学合作共建。杭州江南科学研究院由杭州市政府于2008年重点引进，属于企业法人性质的创新载体，注册资金500万元。研究院位于杭州经济技术开发区杭职创业园内，设有独立研发中心实验室。下设工业生物技术教育部重点实验室浙江分中心、生态纺织教育部重点实验室浙江分中心、工业设计中心、技术咨询中心等部门。

杭州江南科学研究院将根据杭州的产业发展状况，结合江南大学在食品、工业生物、纺织、工业设计等领域的学科优势，推进科技成果在杭州的转化，为企业提供产品研发和技术创新服务。

江南大学作为教育部直属的“211工程”院校，建有国内唯一的“食品科学与技术”国家重点实验室。在食品、工业生物、纺织、工业设计领域具备鲜明的特色，处于国内领先地位，与杭州的特色、重点产业有着良好的对接度，因此杭州市和江南大学的科技合作关系有着广泛的合作领域。