北京有众多黄庄，此处因位于海淀镇南部而得名。“黄庄”本称“皇庄”，源于明洪武年间。明初时的土地分为官田和民田，官田最初叫皇庄、宫庄，是皇室成员所经营的庄园。嘉靖初年（1522年）“改皇庄为官田”，从此京畿不复有皇庄。皇庄虽废，但与之性质相似的官庄一直保存到明末，作为地名流传到清代。辛亥革命以后，取消了帝制，以“皇”字相称的地名被改用“黄”字代替，“皇庄”也就改称了“黄庄”。

北京地铁四号线，十号线途径此地。