硅氧键是硅氧烷的主要结构单元。决定了硅氧烷主链中严格的硅原子和氧原子的交叉排列，也决定了硅氧烷有机取代机排列方式和排列顺序的。
SI-O键较长，部分离子化，带有部分双键特性。线性长链硅氧烷中典型SI-O键长为1.64Å，比大多数碳键长。但和硅原子半径和氧原子半径之和相比短很多。SI-O键的部分离子特性是硅、氧原子电负性差异大的直接体现，SI-O大约会有百分之37到51的离子特性。
硅氧键长决定了硅氧键独特的低温性能，并且是硅氧链具有独特的固有构象柔顺性。硅氧键结构决定了硅氧烷的低温特性，表面特性，黏弹行为，以及高的键解离能，优异的高温稳定性。