临床医学院前身是1979年10月成立的广东医药学院临床教学部，1980年经国家教委批准开办临床医学专业本科，1983年正式成立临床医学系。2005年6月升格为临床医学院，2008年9月与附属第一医院一体化更加拓展了教学、科研和医疗工作。

临床医学院现设有1个本科专业和3个专业方向，即临床医学专业本科专业，临床医学专业本科的中西医结合方向、全科医学方向、计划生育与妇幼保健方向。现有在校学生1126人。目前，我院有正高职称32人，副高职称122人，其中博士学位11人，硕士学位44人；有2人成为广东省高校“千百十工程”培养对象，其中1名为国家级“千百十工程”培养对象，其中1名为省级“千百十工程”培养对象；4人入选学校中青年骨干教师和重点培养青年教师，1人获南粤优秀教师；我院有硕士生导师24人，在省或市专业学术委员会任主任委员以上职务6人。常委12人等。

多年来，临床医学院一直承担并优质地完成我院临床医学、护理学、预防医学、药学等几十个专业近万名本科及研究生的教学任务。为社会培养临床医学专业毕业生1000多人，深受医药单位欢迎，毕业就业率一直保持在97%以上。其中很多同学目前已成为所在单位的技术骨干和各级管理岗位的领导，还有多人获全国五一劳动奖章和省级以上劳模。

临床医学院近三年来共获得省市等各级课题30余项。各种科研经费累计达150余万元。内科学和中西医结合是我院重点学科，外科学是学校重点扶持学科。2006年内科学获得硕士学位授予权。已有在读内科学研究生50多名。设有内科学、外科学、妇产科学、儿科学、诊断学、中医学、神经与康复病学、精神与心理医学、传染病学、皮肤与性病学、眼科学、耳鼻咽喉科学、口腔科学、实验中心、中西医结合研究室等十几个教研室、研究室和技能培训中心。

承担临床医学院教学任务的还有直属的现代化附属医院，有非直属附属医院，附属门诊部，临床教学医院多达百余家。临床技能培训中心现有面积3000余平方米，教学设备投资额共300余万人民币，拥有高级综合模拟人系统、计算机交互式分娩模拟人、急救模拟系统、虚拟静脉注射系统等先进教学设备和外科实验室、模拟层流手术室、护理技能训练室、心肺听诊及腹部触诊训练室、模拟ICU、考试工作站、内、外、妇、儿科模拟病房等临床实验室20余间。可以充分培养学生的实践动手能力