广东省生态环境与土壤研究所成立于1958年。原名中国科学院广州土壤研究所，隶属中国科学院；1978年复所后，定名广东省土壤研究所，隶属广东省科学院；1996年改名为广东省生态环境与土壤研究所。

我所立足于广东省及华南地区特定的生态环境条件和丰富的土壤资源，瞄准广东省经济社会发展战略需求与国内外农业环境科学发展前沿，开展以水土资源为核心的农业环境及其综合治理研究，实现土壤科学、环境科学与农业科学的交叉渗透，为区域生态环境建设、可持续发展做出重要贡献。围绕该学科目标，重点发展的研究方向是：1）土壤质量及其退化修复；2）水土保持与扩散源污染控制；3）农业清洁生产与环境材料。经过数十年的发展，我所在土壤资源调查与利用、农业环境综合治理、固体废弃物资源化利用、水土保持与非点源污染控制、农业环境质量检测与建设、绿色农业种植新技术和多功能新型肥料开发等方面形成了独特的科研优势，已成为以应用研究为主，研究与科技开发、技术咨询服务相结合的省级重要科研机构。现设有四个研究中心，10个科研团队。并建有省重点实验室广东省农业环境综合治理重点实验室，广东省环境科学技术公共实验室。