骨髓嵌合体小鼠（bone marrow chimeramouse）仅指骨髓系统细胞为异性状的嵌合体小鼠，为与免疫、造血系统有关的实验所使用。从A系统的小鼠中采取骨髓细胞，在除去混存T淋巴细胞后，用致死量的放射线（约100 R）照射的B系统或（A×B）F1移于小鼠（通过静脉注射），此时移入骨髓细胞中的造血干细胞在受体内增殖分化，生成所有种类的血细胞（包括淋巴细胞）。结果是受体内的血球所有A系统的全被代换。由于这些细胞的作用，受体可免除放射线致死。