甘肃省教育科学研究所始建于1984年，是甘肃省教育厅直属事业单位，加挂甘肃省基础教育教学研究室、甘肃省中小学心理健康指导中心、甘肃省基础教育质量监测中心，是全省基础教育教学业务管理、教育教学研究和指导学科教学工作的专业职能部门。并负责甘肃省教育学会、甘肃省教育科学规划领导小组办公室的日常管理工作。全所现有在职人员49人，研究人员中本科以上41人（其中博士研究生1人，硕士研究生13人），中学高级教师24人。另外还聘请了一批所外学者、专家、优秀教师为兼职研究员。全所实行所长负责制，现任所长李波，党支部书记王志年，副所长齐志勇、靳建设、弋文武。 所内设有：基础教育教学研究室、基础教育质量监测室、德育研究室、教育发展研究室、国际交流与合作研究室、网络与信息技术中心、教育史志与期刊编辑部、办公室和财务室。甘肃省教育科学研究所创建以来，始终紧紧围绕全省基础教育改革与发展的突出问题，进行教育研究和理论探讨，积极协调全省各级教研力量，侧重于教育科学应用研究、学科教学业务管理及教育科研宏观指导，为教学改革和发展提供了良好的服务，作出了积极的贡献。

进入新世纪，甘肃省教育科学研究所明确以研究甘肃教育改革和发展的理论与实践重大问题为中心任务，努力提升为全省教育行政决策服务和为基层教育教学实践服务的能力，以建设西部教育强省为工作重点，重所风建设，重素质提高，进一步创新体制机制，理顺工作关系，强化教育教（科）研的职能和效能，加强应用研究和成果推广，不断拓宽工作领域，为甘肃教育尤其是为甘肃基础教育教（科）研提供了强有力的支撑和服务。