复旦大学医学院图书馆(即原上海医科大学图书馆)成立于1927年，是我国藏书丰富的医学图书馆之一。馆舍建筑面积8113平方米，馆藏书刊50.1万册。订有中外文现刊1694种左右。图书馆计算机集成系统、光盘镜像服务器2台（121G）及电子文献服务器（428G）与校园网相联。现有工作人员51名。每年接待读者约18.5万人次，书刊流通、利用44.9万册次。

本馆是中国高等医药院校图书馆协会副主任委员馆，全国医学文献资源共享协作网华东地区中心馆，全国医学文献检索教学研究会理事长馆和秘书处，中国医科大学、白求恩医科大学、同济医科大学和湖南医科大学医药信息系毕业生实习基地。 本馆提供文献外借、阅览、复印、检索、馆际互借、视听、校园广播系统、电子阅览、传真、Internet上网、医学查新等服务，并为校内外各类学生、医生及成人教育开设医学文献检索课，还免费向读者开设"利用现代化手段获取信息"方面的演示。1995年7 月编制的"图书馆多媒体导读指南"置图书馆大厅供读者使用。

本馆研制的"微机中西文图书采购系统"于1988年通过上海市卫生局鉴定，并获卫生部优秀软件三等奖；"华东地区西文生物医学期刊馆藏联合目录数据库及检索系统"于1997年12月通过上海市卫生局鉴定。医学文献检索教研室的"研究生文献检索课综合贯通教学法的设计、实施与评价"于1997年获上海市教学成果二等奖。近年来编写的出版物有：《医学核心期刊指南》(1997年10月) 、研究生专用教材《医学信息检索与利用》(1998年7月)和教学用书《信息网络基础及其医学应用》(1999年7月）。