《边患宜靖疏》，康熙六年（1667年），清廷派总兵孔元章赴台湾议抚失败后，施琅亲赴京师面陈康熙攻取台湾之计所上的奏文。 清初，盘踞台湾的郑氏政权屡屡侵扰闽浙沿海，清廷采取截界移民的消极防范对策，百姓深受其害。身为福建水师提督的施琅同情百姓的苦难，不堪忍受防不胜防的被动局面，于康熙六年（1667）呈上《边患宜靖疏》，极力主战。次年康熙帝下旨：“渡海进剿台湾逆贼，关系重大，不便遥定。”宣施琅进京面陈。

提督福建全省水师总兵官、右都督、臣施琅谨题。为边患宜靖、逆贼难容、谨陈荡平机宜、以效忠悃、以奠永安事：窃照郑贼负嵎海上，久阻声教，致干剿讨。遁窜台湾绝岛，恃险负固，虽戢翼敛迹，未敢突犯，而蜂虿有毒，沿边将为不宁。堂堂天朝，万国宾服，岂容此余灰日以滋蔓？朝廷广开洪仁，遣官招徕，德至宽大。兹总兵孔元章招抚回归，只称有的确公移。臣密询押船官林功勋，渡载孔元章往台湾，探贼中情形，未必有归诚实意。使果倾心向化，则海靖边宁，无庸计论。今使命两次到彼，并无的当伪员同来输诚，惟听口传，岂可凭信？倘复顽梗如故，似难中止。臣荷恩深重，与贼仇不共戴，视此逆贼跳梁，能无扼腕？虽躬履险阻，身历波涛，亦必灭此朝食。

伏思贼党盘踞台湾，沃野千里，粮食匪缺。上通日本，下达吕宋、广南等处，火药军器之需，布帛服用之物，贸易备具。兼彼处林木丛深，堪于采造舟楫。以致穷岛一隅，有烦南顾。为今之计，顺则抚之，逆则剿之。若恣其生聚教训，恐养廱为患。且此时经制船只尚堪远驾，过洋舵梢见有可选；迟之数年，船只久坏再造，则损内帑之金，舵梢拨散召募，安得惯洋之人。万一蠢动，属费驱除。以臣愚见，不如乘便进取，以杜后患。夫兴师所难，在于招兵、措饷、制器、造船。今欲大举，所不庸计虑者，闽省水师官兵共一万有奇，经制陆师及投诚闲旷官兵为数不少，皆为防海而多设也。就水师中选拨精锐者可得六、七千，海澄公臣黄梧标下惯海并壮练者可择选二千有奇，尚有投诚未拨散内多有惯海舵梢及精锐者可择选数千。此数若未敷足用，就与陆师中酌选凑共二万，便可合为劲旅。兵在精，不在多也。闽省全辖大小戈船共二百只，选拨一百七十只；小快哨一百只，选拨七十只；其余留为防汛及运载粮糈、传报往来军情之用。应再造大水船十余只以充前锋，另造渡马船二十余只便于配载。计此新造三十余只之船，为费不多。其经制大小戈船，见在题请例应大修，伏乞敕部给此应修银两，发付修葺，不用溢额增加，舟楫业已坚牢。将豫备之兵粮船器，充东征之战胜攻取，无烦征召，不事浪费，戮力讨平，海甸永清，诚长便之举也。

惟是航海远征，后先抵岸，各兵凑集，非亲经训练，临时难以信恃。兵额既定，分拨八千为水，在船以接战；一万二千为陆，登岸以进取。臣将此二万之师，分为水陆，躬督操练，加之数月，将得兵心，兵知将意，方可渡海远征。至于选任将领，畴堪前矛，畴堪后劲，必其经历战攻、身先士卒、夙有成效者，乃堪委任。臣于闽中经制及投诚将领稔知有素，另俟命下之日，会议选拨定数，具册报闻。

臣矢志报国，敢遗余力？第思任维艰而责綦重，伏乞皇上赐臣稍以便宜，得于军中申严号令，庶肩功克奏。又当密敕藩督抚提诸臣，会商妥确，催督修造战船，备足粮饷，选调官兵，付臣整练完备，相机进取。居者行者各尽其力，则动出万全。前次东征，两阻风涛之险，逆贼虽未扑灭，人谋亦未允臧。投诚官兵，眷口多在彼处，新附人心，参差未一。鸠乌合之众，以事敻海之表，其未至误公者，诚赖国家之福！臣奉有成命，勉应击楫，固逆知其难也。今臣思选拨将士，修葺船只，操练习熟，纪律严明，成算在胸，故敢虑胜而动。盖澎湖为台湾四达之咽喉，外卫之藩屏，先取澎湖，胜势已居其半。是役也，当剿抚并用。舟师进发，若据澎岛以扼其吭，大兵压近，贼胆必寒，遣员先宣朝廷德意。如大憝势穷，革心归命，抑党羽离叛，望风趋附，则善为渡过安插，可不劳而定。倘执迷不悔，甘自殄绝，乃提师进发，次第攻克，端可鼓收全局矣。

但征外岛，风信靡常，当假以岁月，不可限以定期。臣整备舟师，枕戈待时，或急遽以掩袭，或慎重以制胜。奏捷迟速，虽难豫定，然满腔血诚，贼一日未灭，臣一日未安，筹度时势，定当扫余氛而拯黎元，义不以贼遗君父。且数年以来，沿边江、浙、闽、粤，多设水陆官兵，布置钱粮，动费倍增，皆为残孽未靖之故。如台湾一平，防兵亦可裁减，地方益广，岁赋可增，民生得宁，边疆永安；诚一时之劳，万世之逸也。若以臣言可采，伏乞皇上敕部议覆施行（康熙六年十一月二十四日题）。

康熙七年正月初十日奉旨：“渡海进剿台湾逆贼，关系重大不便遥定。着提督施琅作速来京，面行奏明所见，以便定夺。其施琅之缺，着施琅自行择人暂令代管。兵部知道。”