德清县疾病预防控制中心是由原县卫生防疫站调整新建的集疾病预防控制、卫生监测检验与评价、健康教育与促进、应用研究与指导、技术管理和服务为一体的公共卫生事业综合机构。该中心现有8个职能所室（突发公共卫生事件应急办公室、疾病防治所[结核病防治所]、慢性病防治所[地方病防治所]、环境与职业病防治所、健康教育所、微生物理化检验所、预防医学门诊部和中心办公室[质量管理办公室] ），在编职工34名。拥有5000m2业务大楼，其中实验室用房1300m2。配备了原子吸收分光光度计、气相色谱分析仪、高效液相色谱分析仪、酶标分析仪、紫外分光光度计、B型超声诊断仪、心电图仪、生化分析仪、血液细胞分析仪、尿液分析仪等一批先进的检测、诊疗仪器和设备。2001年9月该中心实验室通过中国实验室国家认可委员会认可，在全国县级疾病预防控制中心（卫生防疫站）是首家获实验室国家认可的卫生检验机构。

多年来，该中心认真贯彻党的路线、方针、政策和“预防为主”的卫生工作方针，坚持为人民服务的宗旨，坚持为基层、为群众服务的方向，以发展为主题，解放思想，抓住机遇，真抓实干，开拓进取，结合创建文明行业、文明单位活动，积极推进卫生防疫改革，取得了显著成绩。1999年获湖州市文明单位，2000年获全国县级一等卫生防疫站，2003年4月被省委、省政府命名为省级文明单位。