单链构象多态性（single strand conformation polymorphism,SSCP）分析是利用DNA或RNA单链构象具有多态性的特点，结合PCR技术进行基因检测的一种分析技术，称为PCR-SSCP技术，用以分析微生物的遗传学特征和基因突变。由于毛细血管电泳技术能在数十分钟内将PCR扩增片断分离出双链及单链峰，仅有一个碱基差异的两条DNA也能得到较好的分离，说明毛细血管电泳技术用于PCR-CE-SSCP是一种快速、有效的筛选基因点突变的方法。采用细菌rRNA基因（16SrRNA 23SrRNA）分析，对微生物进行分类鉴定，对绝大多数血培养阳性分离株及分支杆菌属细菌的鉴定，均显示出良好的分辨效果。而且对结核分支杆菌的各种耐药基因检测，对喹诺酮类药物耐药决定区基因突变的检测已成为常用的方法。如用限制性内切酶水解PCR片断，还可进行限制性片断长度多态性分析，PCR-CE-SSCP技术在微生物分类、新种类鉴定、分子流行病学调查中均具有重要作用。