川云顶山脉由仙游县大尖山延伸入境，经灵川镇的云顶山，延至渠桥乡的壶公山，海拔一般在200～700米。其中，壶公山为最高峰，海拔710.5米。山两侧均有东西向断层通过，显得巍峨挺拔。

在沿海半岛和岛屿部分有许多低山、丘陵，如青山(海拔146米，在黄石境内)、天马寨(海拔132米，在黄石境内)、昆仑山(海拔122米，在北高境内)、五侯山(海拔329米，在笏石、北高、东峤交界)、金山(海拔71米，在东峤境内)、岱前山(海拔110米，在忠门境内)、鹭峰山(海拔311米，在平海、东峤交界)、大蚶山(海拔398米，在埭头境内)、九重山(海拔162米，在南日岛)、大峤山(海拔168米，在南日岛)、鹅尾山(海拔75米，在湄洲岛)、乌丘屿(海拔76米，在大丘屿)等。