本圀寺之变是织田信长奉足利义昭上洛后，三好三人众的反扑战役，趁织田信长退回美浓时，联合旧美浓国主斋藤龙兴领兵袭击足利义昭，此战也被称作六条合战。

过程

织田信长在前一年奉将军足利义昭上洛时，击破三好三人众的军势，扫荡他们在山城国、河内国的领地，不忿的三好家势力遂趁织田信长离开京都回归岐阜城时，揪合斋藤龙兴及其旧部，对居住在本圀寺的足利义昭发动攻击。

当时，留驻在本圀寺的织田家臣明智光秀迅速组织抵抗，并且派出使者向四方友军求援，在他麾下的山县源内、宇野弥七奋战下数度挡住三好军先锋药师寺贞春的攻击，但在反复交战之际，寺门已被烧毁，三好军几近攻入寺内，据信长公记所载，尽管局面相当混乱，织田军还曾利用弓箭或洋枪，一次射倒敌军三十人，战斗过程十分激烈。

而三好义继、细川藤孝、池田胜正、荒木村重、伊丹亲兴等织田方援军迅速云集，从后方进迫桂川河畔的三好军本阵，击败三好军且使其退却。

战后，明智光秀派出的军使也进入岐阜城通报织田信长，信长领大军兼程而行把本来需耗3日的行程缩短至2日，火速进入京都，除了奖赏此战有功人士，也感觉本圀寺守备力不足，而着手另行建造二条城给将军足利义昭居住。