北京热带医学研究所挂靠于首都医科大学附属北京友谊医院，是我国成立最早的，也是我国北方地区唯一的热带医学研究所。创建于1978年，首任所长为中国科学院院士我国著名热带病专家、北京友谊医院首任院长钟惠澜教授，叶剑英元帅亲笔为研究所题名。研究所主要开展热带病，特别是寄生虫病的临床与科研工作，多年来坚持科研、临床相结合的工作方法，建立了热带病形态学、免疫学及分子生物学检查体系，接诊来自北京、全国及世界热带病流行地区归国的热带病患者。该所是全国最早被WHO任命的世界卫生组织（WHO）合作中心，自1981年起曾先后任世界卫生组织利什曼病、肝吸虫病、肺吸虫病合作中心，目前为WHO囊虫病合作中心。

经过几十年的发展，研究所形成了一支拥有高素质人才的科研队伍，与世界卫生组织、热带病研究规划署等国际机构以及国家疾病预防控制中心、皮肤病研究所等合作在寄生虫病的诊断、治疗、防治策略等方面已开展了数十项研究项目和科研课题，并取得了一系列研究成果，李桓英教授曾获得国家科技进步一等奖，在国内外拥有极高的信誉和知名度。

北京作为我国的首都，随着与亚洲、非洲与拉丁美洲等热带病高发国家联系的日益紧密，北京热带医学研究所在建立符合国际水平的热带病诊断实验室、应用规范的检测技术建立快速、高效的热带病诊断技术平台等方面担负着重大的任务。