北京大学台海两岸现代化研究中心（The Center for Modernization Studies across the Taiwan Strait, Peking University.，英文缩写CMSTS, PKU）成立于2007年11月15日，经北京大学批准成立，隶属于北京大学历史学系，依靠社会募集资金从事学术活动，是非营利的公益性研究中心。在宪法、法律和政府相关政策及北京大学相关规章范围内开展工作。通过组织中国大陆和台湾的学者，研究中国大陆和台湾海峡两岸现代化进程，总结两岸现代化进程中的经验与教训，促进两岸的学术交流与合作。目前，中心主要研究中国大陆和台湾地区现代化进程，出版相关研究报告、文章、影视作品，组织相关学术交流、研讨会及学术考察活动。

中心现任主任为杨奎松。