北海市疾病预防控制中心，是根据国家卫生部“卫生两项体制改革”要求，在原北海市卫生防疫站的基础上，合并原卫生宣教馆、银海区卫生防疫站、铁山港区卫生防疫站，于2003年12月正式组建成立，相当副处级财政全额拨款事业单位。内设办公室、财务总务科、质量信息管理科、流行病科、性病艾滋病防制科、免疫预防科、消毒与病媒生物防制科、公共卫生监测评价科、检验科、健康教育与促进科、预防医学门诊部、铁山港区科等12个职能和业务科室。已获得省级计量认证合格单位、工程室内环境质量检测机构、艾滋病初筛实验室、室内空气质量检测指定实验室、预防性健康检查机构、职业卫生技术服务机构、职业健康检查机构等专业资质。实验室装备了气质联用仪、原子吸收分光光度计、全自动微生物分析仪、全自动生化分析仪、十万分之一电子天平、暗视野荧光显微镜等一大批大型进口的具有国际先进水平的预防性检查、卫生监测检验仪器设备；能开展各类检测共9大类201项，是北海市开展检测项目最多、实力最强的卫生检测实验室。