北航飞行学院成立于1993年，是由北京航空航天大学与南方航空公司共同合办的。是国内首家由大型企业和著名高校共同合办，实行校企紧密结合、国内外开放式办学的学院。从1993年至今，北航飞行学院共招收飞行学员2064人，已经毕业超过1000人,占南航飞行员总数三分之一以上，其中责任机长以上200余人，2005年招生335人。北航飞行学院充分发挥和利用北航已有教学资源，在培养模式、教学计划、课程体系、内部管理等方面相比北航原有的体系进行了重大改革，形成了独特的培养模式和办学体制。飞行学院的主要课程分为6大部分：基础课程、专业基础课程、专业理论课程、飞行训练课程、飞行实习和毕业设计。基础课程开设高等数学、英语、政治等；专业基础课程以工程力学、电工电子、专业英语等课程为主；专业理论课以综合课程为主，包括飞机、发动机、机载设备、航空气象、领航学、自动飞行控制、维修等；飞行训练课程包括西澳飞行学院教练机飞行课和珠海飞行训练中心模拟机飞行课程；飞行实习安排到南方航空公司各分公司进行，毕业设计论文根据北京航空航天大学的要求进行。飞行学院现有授课教师30余人，全部面向北航其它院系和外校聘任。