阿里战争是藏军成立后，单独进行的一次抗击英帝国主义侵略的战役，清史称为阿里战争。1841年(道光二十一年)，英帝国主义的势力已伸到印度的西北部。他们扶植森巴人头人倭色尔入侵拉达克地区，勾结当地头人答朗堪携英国授予的铜炮，向我国阿里地区发动了进攻。英国人为何要支持森巴军队入侵阿里地区？这还得从头说起。1600年(万历二十八年)，英殖民主义者在印度成立了东印度公司，从事商业经济掠夺。1757年(乾隆二十二年)，英国打败印度孟加拉后，整个印度沦为英国殖民地。【按照英人的北侵计划，到1849年，英国才征服印度全境，值此印度成为英国在东方殖民体系中政治、经济中心和向亚洲进行侵略的战略基地。因此，阿里战争的实质，是我国一次反殖民统治的正义之战】。

清道光二十一年(1841年)，西藏阿里地区发生战争。当时阿里的西面有一个部落叫拉达克，这个地方本是西藏的属地，归达赖喇嘛管辖。据《西藏图考》记载：“后为西藏界外野番森巴侵占其地，走唐古忒求救，驻藏大臣拒之弗纳，拉达克怨，反投森巴，诱之寇唐古忒，欲复茫丘纳山西故地”。

1838年(道光十八年)，森巴军(原古藏王卫队)大举进攻拉达克。当时负责守护拉达克边界的噶本萨普·扎西旺秋父子等与森巴军队进行了英勇的战斗，但由于武器装备差而失败，结果拉达克全境都被森巴军占领，每年需向古拉屋森双国王交纳9000个银币的战争赔款。五年后，森巴将军哇杂尔·苏罗瓦尔得寸进尺，又领兵到拉达克，另立拉达克王，组成森巴和拉达克联军进犯阿里。联军从北路首先攻破日土，驻防阿里的藏军第五代本团500名士兵进行了顽强阻击，终因敌强我弱，弹尽粮绝，援兵未能赶到而告失守。森巴和拉达克联军占领了阿里的如妥、噶达克、达巴、补仁、杂仁等五个宗(县)，阿里地区全部失陷。

森巴人侵入阿里地区以后，焚烧劫掠无所不至，并占据了芒人域的补人寨，森巴人逐步侵入到马法木错南岸，准备进一步侵取阿里地区。当时国内正值鸦片战争期间，清朝政府无兵派往西藏，只能将藏军派往前线单独作战。西藏驻藏大臣调派了噶伦才丹多吉和代本比喜，率领藏军第二、第三代本团1300人，前往阿里进行反攻。清朝政府对这场战争极为重视，特命驻藏大臣将存放在拉萨武器库房的12门劈山大炮交给藏军使用，“以资攻剿”。由于森巴人勇悍善战，战争伊始藏军未能取胜，噶厦(西藏地方政府)又抽派前、后藏民兵500人，前往增援。

据藏文史料记载，1842年，即藏历第十四饶迥水虎年，克什米尔国王古拉屋森双派出8000骑兵进犯西藏。驻守阿里的藏军进行了英勇的抵抗。在森巴和拉达克联军开始进攻阿里时，阿里噶本派人向拉萨方面报告，驻藏大臣得知后，即命西藏地方政府派后藏代本壁喜哇和前藏代本索康巴·塔林才旦率兵驰援。在普兰达拉喀，藏军杀死了据守城堡的50名森巴军后，占领了城堡。但是，由于藏军武器装备差，初战失败。当时藏军扎营于低洼处，被森巴军乘机引水灌淹。藏军将领璧喜、索康及兵士50余人被俘。于是驻藏大臣再次命令西藏地方政府和阿里地方的人民积极配合藏军驰援阿里。征调兵员组成了3000人的藏军，任命噶伦才旦多吉为统帅，尽快开赴阿里。此时哇杂尔·苏罗瓦尔集中优势兵力向普兰达拉喀城堡发起了进攻。城堡中的藏军凭险固守，寸土不让。一日，在马法木湖南岸，时值寒冬，天降大雪，森巴军不耐严寒，行动困难。西藏军队乘机反攻，藏军冲出城堡，杀入森巴军营。在双方混战中，哇杂尔垂死挣扎，十分凶狠，藏军将领米玛认出他就是匪首，于是舍生忘死冲向前去，一矛刺中其胸膛，森巴军失去指挥，大败而去。此次征战，森巴军头人倭色尔在炮火中炸死，森巴军千人被俘虏，阿里全部失地，被藏军收复。

据《卫藏通志》记载：道光二十二年(1842年)冬，阿里地区降大雪，雪深数尺，森巴军不耐寒冷，藏军乘冰天雪地利用森巴人不敢外出的有利条件，以12门劈山大炮和连环枪进行反击，森巴军大败，大头目倭色尔(森巴军头领)在炮火中阵亡，森巴军被藏军杀死200余人，俘虏800余人，并把森巴军一直追到西藏与拉达克边境，阿里失地全部收复。

森巴人经此次战役失败后即与西藏议和谈判，议定西藏和拉达克问仍维持旧有边地各守本土，并按照旧例西藏每年派政府商队到拉达克。拉达克每年派人到藏献供礼品，拉达克商人可到噶尔、日土等地贸易。西藏的商人也可以到拉达克贸易，双方维持以往的信任关系。并将侵占的拉达克地方完全退出，管辖权交给拉达克酋长治理。

这次战役粉碎了英国侵略者的扩张阴谋，保卫了祖国西南边疆。清廷对在这场战斗中的有功人员实施了奖励，给予帕巴拉·索朗杰布二品台吉头衔的提升。理由是他奉命留在拉萨负责军需补给和运输事宜，办事有条不紊，卓有成效，并在看管阿里多格拉和拉达克的俘虏方面，对战役取胜做出了成绩。为此达赖喇嘛也设宴款待了在反击森巴侵略者中的有功将领。