在中国和丹麦业已成功开展科研合作的基础上，为了进一步推进双方在知识、科技、人才方面的交流，中国科学院研究生院与丹麦科技创新部和丹麦高校联盟共同决定，在中国科学院研究生院（以下简称为研究生院）北京雁栖湖校区共建中国-丹麦科研教育中心（简称中丹科教中心)。

2008年5月21日，丹麦科技创新部和丹麦高校联盟代表团访问了研究生院，探讨并展望了研究生院和丹麦高校开展全面合作的前景。2008年9月8日, Ole Fejerskov 教授率团再度走访研究生院并宣布，研究生院评选为共建丹麦大学海外中心的首选推荐合作伙伴。该海外中心即为后来正式命名的中国丹麦科研教育中心。

2008年10月22日，中国温家宝总理和丹麦拉斯穆森首相在人民大会堂见证了共建中丹科教中心合作备忘录的签署。10月23日, 拉斯穆森首相在中科院研究生院出席了《中国科学院研究生院与丹麦科技创新部、丹麦高校联盟合作备忘录》签字仪式。

根据备忘录，丹方将在研究院的雁栖湖校区投资建设一个约8000平方米的中丹科教中心大楼。中丹科教中心将具有独特的设计、建筑和绿色科技应用特征。建成并运作后，中心将拥有来自中、丹及其它国家的100名科研人员和300余名研究生。同时，它还将为350余家在华丹麦企业提供相应服务。中丹科教中心教学使用英语，鼓励学科之间的融会贯通和创新性思维模式。

除了承担教育职能，中丹科教中心还将是一个中丹科研合作和科技人才交流的平台。中丹科教中心与中科院各研究所合作运行，欢迎中国其它高校的参与。

中丹科教中心先期关注的学术领域包括：（1）生命科学与生物制药；（2）纳米科学与纳米技术；（3）再生能源；4）水与环境；（5）福利研究与创新管理。

2010年4月12日上午，在温家宝总理和丹麦首相拉尔斯·拉斯穆森先生的共同见证下，中科院常务副院长兼研究生院院长白春礼与丹麦科技创新部部长Charlotte Sahl-Madsen、丹麦高校联盟主席JensOddershede在人民大会堂签署了《中国科学院研究生院中国-丹麦科研教育中心合作伙伴协议》（伙伴协议）和《中国科学院研究生院雁栖湖校区中国-丹麦科研教育中心建设、维护和运行协议》（大楼协议）。协议明确由丹麦工业基金会捐赠8000万丹麦克朗（约合1亿元人民币）作为中丹科教中心大楼建设资金，中科院研究生院在雁栖湖新校区提供建筑用地。中丹中心计划于2013年正式运行。