是指脂肪酸的末端（w-端、烷基端）甲基发生氧化，先转变成羟甲基，继而再氧化成羧基，从而形成a,w-二羧酸的过程。然后从二羧酸的两端同时开始进行b-氧化。

w碳原子的氧化包括所及氧化，有细胞色素P450参与反应，催化此反应的酶为单加氧酶，它需要NADPH和O2参与反应。羟基即氧化为羧基，两端羧基都可与COA结合，并进行b-氧化。w-氧化的底物为长链和中长链脂肪酸。w-氧化加速了脂肪酸降解的速度。