原生动物门的鞭毛纲的一个重要类群。

鞭毛纲根据营养方式的不同．可分为两个动鞭亚纲和植鞭亚纲：

植鞭亚纲（phytomastigina）： 一般具有色素体能行光合作用，自由生活在淡水或海水中。种类很多，形状各异，眼虫即用于此亚纲。也有无色素的类群，是在进化中失去了色素体，其结构与有色素体的类群基本相似。

此外也有群体，如盘藻，一般由4-6个个体排在一个平面上如盘状。每个个体都有两根鞭毛。有纤维素的细胞壁，有色素体，每个个体都能进行营养和生殖。又如团藻由成千上万个个体构成，排成一个空心圆球形，由简单的生殖和营养个体的分化。

生活在海中的如夜光虫，颜色发红，大量繁殖时会引起赤潮。同属于腰鞭毛虫的其他一些种类也能引起赤潮。

不少淡水生活的种类会引起水污染。

但绝大多数的植鞭毛虫是浮游生物的组成成分，是鱼类的自然饲料。

包括：

（1）：金滴虫目。

（2）：隐滴虫目。

（3）：腰鞭毛目。

（4）：眼虫目。

（5）：绿滴虫目。

（6）：团藻目。