2003年8月浙江科技学院基础教学部更名为理学系，2005年6月在原理学系基础上组建理学院，目前学院下设2系1中心5所，即：数学与信息科学系、应用物理系、实验实习中心、功能材料研究所、应用数学研究所、科学工程计算研究所、应用物理研究所、光电信息技术研究所。“材料物理与化学”学科为校级重点学科。学院作为基础性学院，承担着面向全校学生的高等数学、线性代数、概率论与数理统计、概率统计与随机过程、复变函数与拉普拉斯变换、复变函数与场论、大学物理、大学物理实验等基础课程的教学任务。

学院现有信息与计算科学、应用物理学两个本科专业，其中信息与计算科学03年开始招生，应用物理04年开始招生，03级信息与计算科学专业首届毕业生81名,04级信息与计算科学专业与应用物理学专业毕业生共计113名。全院学生人数为492人，另外与德国联合培养有“2+3”应用物理专业学生20名。

学院教学师资与管理队伍结构合理，队伍稳定，素质较高，具有高度的事业心和责任心。学院目前有教职工共59人，专职教师53人，其中教授7人，副教授20人，高级工程师1人，副研究员2人。教师中有博士10人（其中2人为博士后），在读博士4人，硕士21人，40岁以下的青年教师全部具有硕士及以上学位。教师中有省教学名师2名，省优秀教师2人，省级“三育人”先进个人2人，151人才第二层次人员1人，第三层次2人，浙江省教育系统“事业家庭兼顾型”先进个人1人，浙江省高等学校教学技能比赛优秀奖2人。高级职称占44.9%，中级职称占24.5%。

目前学院有《大学物理》、《大学物理实验》、《高等数学》、《线性代数》、《数学分析》5门校级优秀课程；《基础物理》、《数学模型》、《高等代数与解析几何》、《概率论与数理统计》《物理与人类文明》、《常微分方程》、《保险精算学》7门校级重点课设课程。近年由学院负责指导我校学生参加全国大学生数学建模、浙江省高等数学竞赛、浙江省大学物理实验技能竞赛，取得全国一等奖2项、二等奖3项，浙江省一等奖7项，二等奖28项，三等奖57项，近两年相关竞赛的成绩在省内名列前列。

近年来，学院积极开展教学研究与科研工作，围绕我校应用型高级人才的培养特色，完成了多项省级及校级教学改革研究与实践项目，开展教学实践活动，并取得了丰富的教学成果。相关教学成果获得省优秀教学成果二等奖1项，获省级精品课程1门，有5门校级优秀课程，7门校级重点建设课程。近三年以第一作者在国内外学术刊物上发表论文112篇，三大索引收录24篇，编写出版教材专著15部，主持完成各类科研项目50余项，其中，主持国家自然科学基金专项1项，863子课题1项，省部级项目10项。

学院实验中心设有物理实验室（大学物理实验室、应用物理专业实验室）、数学实验室（信息与计算科学专业实验室），实验室面积2500m2（规划面积4500m2）。设备总台套数1272件，总值 372万元。 近年来学校及省财政厅对学院实验中心进行较大规模的投入，建设了设备先进的数学实验室，大学物理实验室、近代物理实验、应用物理专业实验等，其中大学物理实验99年通过教育厅合格实验室评估。学院刚刚完成物理演示实验室建设，数学实验室扩建仪器已完成验收，物理创新实验室已立项建设，近三年投入实验室建设总金额达270万元。这些实验室可以充分满足学生必要实践教学和培养学生实际动手能力的需要，同时也为广大师生提供了较好的科研条件。为强化应用型人才的培养，学院与浙江天煌科技实业有限公司、浙江天正思维信息技术有限公司等校外11家企业签订了共建实习基地的协议。

学院广泛开展对外交流，不仅与国内多所高校及科研院所建立了交流合作关系，而且有经常性的国际交流与合作，学院于2005年5月和2006年5月分别与德国科堡应用科技大学、奥登堡/东弗里斯兰/威赫姆斯港应用技术大学等签订了联合培养本科生的“2+3项目”及科技合作与师资交流协议，定期派教师到对方做学术访问或进行合作研究。