词条 | 异常剪接 |
释义 | 对序列库中异常剪接mRNA的鉴定和分析 本文设计了一套策略:来找出数据库中存在的chromosome translocation、mRNA trans-splicing、multi-locus transcription、antisense transcription等异常剪接的mRNA 。 一方面自然潜在的这种异常剪接方式有重要的生物学作用。比如chromosome translocation可以下调某种基因的表达或者产生致癌基因,诱导癌细胞的生长选择优势;反式剪接的主要功能是处理多顺反子性转录单元,调控转录效率和mRNA的稳定性,同时可以增加产物蛋白的多样性。antisense transcription众所周知有下调某基因表达的作用。所以鉴定出目前数据库存在的这些异常剪接mRNA有重要的功能意义。 另一方面,由于试验中的错误联配和反向转录,会造成许多人为的异常剪接情况,比如嵌套基因、基因组污染等。这些序列必须从库中遴选出改正或抛弃。 本文重要的借鉴意义在于它的策略流程:如下图: 每一条过滤规则都有其意义,需深入理解 |
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