盐田港保税区的保税物流园区于2004年8月16日经国务院批准开展区港联动试点，物流园区为海关实施监管的特殊经济区域，面积为0.96平方公里，重点发展国际物流、国际采购、国际中转和转口贸易。物流园区除享有保税区的政策外，在进出口税收方面，国内货物进入园区视同出口，办理出口报关手续，实行退税,并且可以复进口,完全取代以前出口转内销需要去香港兜圈的模式；园区货物运往内地，办理进口报关手续，按物料实际状态征税。另外,盐田港保税区位于盐田港港区内，设有区专用通道直通码头作业区,24小时作业.