生于天文11年（1542年），卒于元和6年（1620年）。近江朝妻城主新庄直昌的次男、新庄直赖之弟。

1549年新庄直昌战死后，新庄直忠继任了家督之位，成为近江国新庄城城主。初时为室町幕府将军足利义晴，后又效力于织田信长与丰臣秀吉。1583年领受近江国浅井郡200石。后剃发出家，号冬玉入道。

1591年被丰臣秀吉赐予近江蒲生郡250石，后于1593年加增近江坂田郡300石，1595年11月又加增加一万900石，总计1万4千6百石。1592年与文禄之役中奉命渡海赴朝鲜参战。

新庄直忠文武兼优，其效力过的主家对他的品评都很高，这也是他领地不断加增的原因之一。