微生物岩（包括未成岩的沉积物）常常是孤立或是紧密相连的丘状体或是平坦的层状体。丘状体统称为微生物岩隆（Microbial buildups），也称微生物泥丘（Mud mounds）,包括文献上所称的各种藻礁、藻粘岩、藻灰华、藻球、海滩岩、叠层石、叠层石岩礁等；层状体即微生物纹层石（Microbial laminarites）,包括文献上所描述的藻席、层状叠层石和隐藻纹层碳酸盐等。

微生物岩的确切定义为：“微生物岩是由底栖生物群落的生长和生理活动引起沉积质点粘结和圈捕和/或表面矿物沉淀和/或生物矿化作用而产生的生物沉积岩”。其主要的类型包括叠层石、核形石、树形石、凝块石，某些鲕粒、团粒、球粒和泥晶。其物质成分可由碳酸盐岩、磷块岩、铁岩、锰岩和有机质页岩组成，也可由硫化物岩、硫酸盐岩、粘土岩和各种碎屑岩组成。其形成环境从海洋(滨海至深海)、湖泊、河流、喷泉，到洞穴、风化壳和沙漠。