皖南医学院从办学伊始，即创立了卫生学教研室，当时主要承担本、专科《卫生学》课程。20世纪70年代以来，老一辈公共卫生专家治学严谨、团结合作，他们带领教研室全体老师深入街道、居委会和乡村，先后与美国哈佛大学公共卫生学院、北京医学院等开展国际、国内合作科研。1985年，《流行病学》课程纳入卫生学教研室，由此“卫生学教研室”更名为“预防医学教研室”。1998年《预防医学》获“皖南医学院一类课程”称号。2010年5月皖南医学院预防医学系成立,现设立预防医学教研室、流行病与卫生统计学教研室、劳动卫生与环境卫生学教研室、营养与食品卫生学教研室、预防医学实验中心和医学科研设计与数据处理中心。

师资队伍：全系现有专兼职教职员工23人（教授1人、副教授3人、高级实验师1人、讲师7人、实验师2人、助教9人），其中硕士生导师2人，具有博士学位2人、硕士学位20人。安徽省高校优秀中青年骨干教师1人，安徽省师德先进个人1人，安徽省高校省级教坛新秀1人。

教育教学：预防医学本科专业从2008年开始招生，目前在校本科生557人，生源来自安徽、江苏、浙江、河北、湖北和云南。从2006年开始，预防医学系与相关学科（学位）点联合招收硕士研究生，主要从事医学统计学、心理统计学、行为流行病学和慢性病传染病流行病学研究，已毕业5名研究生，在读研究生17名。预防医学系承担预防医学专业《卫生统计学》、《流行病学》等13门专业课和全校非预防医学专业《预防医学》、《医学统计学》、《临床营养学》、《药物统计学》等15门专业基础课以及研究生《医学统计学》、《心理统计学》、《流行病学》等6门课程的教学任务。

学科建设：2009年《预防医学》荣获安徽省省级精品课程和皖南医学院校级精品课程。近年来，预防医学系积极加强与兄弟院校交流，编写各类教材24部，其中主编安徽省“十一五”规划教材《医学统计学》、《流行病学》2部；副主编《预防医学》、《预防保健学》、《医学科研方法》、《临床流行病学》、《医学统计学》、《临床营养学》、《流行病学实习指导》等教材7部；参编《流行病学》（案例版）、《医学研究的数据管理与分析》、《EpiData软件实用教程》、《心理统计学》、《心理科学研究方法》、《医学统计学》、《医学科研方法与临床流行病学》、《预防医学》、《心理评估学》等教材15部。

科学研究：5年来，预防医学系共获得国家级、省部级、厅局级项目38项，其中主持国家自然科学基金1项、国家“863”子课题1项、安徽省自然科学基金1项、共青团中央课题1项，全球基金艾滋病项目12项、安徽省教育厅自然科学基金项目13项（重点项目1项、一般项目12项）、安徽省教育厅教学研究项目1项、安徽省教育厅人文社科基金5项、芜湖市科技计划重点项目3项以及皖南医学院校级课题15项。获校级教学成果二等奖2项、三等奖1项；在国内外期刊发表学术论文100余篇。