桃江刺鲃国家级水产种质资源保护区总面积1655公顷，其中核心区面积780公顷，实验区面积875公顷。核心区特别保护期为每年4-9月。保护区位于江西省赣县境内的桃江，即信丰县与赣县产交界处至赣县居龙潍水电站，范围在东经115°08′31″-115°00′01″，北纬25°48′32″-25°29′40″。其东岸为居龙滩-洛屋-和尚坪-湾子高-球头窝-新屋下-东坑子-夏汶滩 -尚汶滩-横溪-羊脚滩-双山下，西岸为河头-西坑口-金田-芒头窝-大埠-王母渡-下排-坝里-立濑。核心区位于大埠（115°05′19″，25°42′45″）-横溪（115°01′27″，25°33′21″）之间，实验区位于居龙滩水电站（115°06′34″E，25°48′32N）-大埠（115°05′19″E，25°42′45″N）和横溪（115°01′27″E，25°33′21″N）-立濑（115°00′52″E，25°29′40″N）之间。主要保护对象为刺鲃，其他保护物种包括吻鮈、翘嘴鲌、黄颡鱼、鲂、大鳍鳠、鳜等。