太医局在医学教育方面的作用，在宋代有了更为长足的发展，已经成为一个专门的医学教育基地，源源不断地为翰林医官院提供优秀的人才，并输送到宫廷。

太医局首先对学生的来源严格把关，通常在每年春季招生，规定年龄在15岁以上，有召命官、使臣或翰林医官做保，学生3人一组，结为连保，在太医局旁听一年后才能获得一个候补的入学资格。所谓的候补入学资格，就是不能马上就进入太医局学习，因为太医局每科的学习人员都有定员，只有等有了空缺，获得候补入学资格的学生才有机会参加这科的选试。选试的题目是问答题，考官会提出10道题目，这些题出自《难经》、《素问》、《诸病源候论》、《神农本草经》等书的内容，回答出5道以上为合格，由太常寺发给一个正式入学资格的“牒”，这样才可以进入太医局开始真正的学习。学制为三年，毕业还要有考试，考试优秀的，可以选送到翰林医官院。