孙寺遗址有两个：其一在山东菏泽成武县孙寺镇孙寺村，以村命名，属于“龙山”、“岳石”、“商”、“周”和“汉代”等时期的文化遗存；其二在安徽临泉县瓦店镇郑卞村孙庄自然村，根据村庄和寺庙命名，是明末寺庙遗址。

山东菏泽孙寺遗址

安徽临泉县孙寺遗址

山东菏泽孙寺遗址

该孙寺遗址属于山东菏泽现存的大汶口及龙山文化。遗址位于成武县孙寺镇孙寺村东端，一部分被供销社所占压。遗址东西约100米，南北约90米，总面积9000平方米。

从采集的标本看：龙山时期的有泥质灰陶方格纹罐片；岳石文化的有夹砂褐陶素面罐、蘑菇形器盖；商代有夹砂灰陶绳纹鬲；周代有罐的口部；汉代的有泥质灰陶罐、豆、瓮等。由此可见，该遗址包含龙山、岳石、商、周、汉代等几个时期的文化遗存。保存状况基本完好。

安徽临泉县孙寺遗址

该孙寺遗址坐落于临泉县瓦店镇郑卞村孙庄自然村西部，距瓦店镇南5公里，遗址南北长100米，东西宽约35米，面积约3500平方米。

经临泉县文广新旅局专业人士对孙寺遗存物鉴定，该遗址是明末建在宋代遗址或寺庙上。根据专业人士对遗址上拣选的标本宋代瓷碗、杯残片及大量的砖块、瓦片及2米厚的文化层鉴定，孙寺为宋代遗址。院内出土汉白玉佛像底座和正面饰有龙戏珠并刻有“重修观音寺”、背有“皇帝万岁”字样的碑刻，应属寺庙遗物，为扒庙时所掩埋，从造型看应是明代末年遗物。