阿巴嘎蒙古语“叔叔”之意。因部落首领为元太祖成吉思汗同父异母弟别里古台后裔，故将其所率部落称为“阿巴嘎”部，延用下来。明属察哈尔，清崇德、顺治间归附清朝。崇德四年（1639），塔尔尼库同曾孙多尔济率所属迁回漠南，归附清朝。右翼旗设于祟德六年（1641），左翼旗设于顺治八年（1651）。嘉庆间，两旗间各有佐领十一。牧地近库尔察罕诺尔，约当今内蒙古阿巴嘎旗。隶锡林郭勒盟。

阿巴噶左旗地域为东接浩齐特，西邻阿巴哈纳尔右旗，南起正蓝旗察哈尔，北抵阿巴哈纳尔左旗，大体相当于今天的锡林浩特市。阿巴噶右旗位于苏尼特东部。旗地东妆阿巴哈纳尔右旗，南接正蓝旗察哈尔，西与苏尼特旗相邻，北和达里冈爱牧石交界。大体相当于今天的阿巴嘎旗西部。