上庄二中地震观测台位于北京市海淀区最北部的上庄乡上庄二中校内，距佛香阁北偏西14.5公里。上庄公路东侧，沙阳公路南。

上庄二中地震观测台处于小汤山-东北旺断裂带和南口-孙河断裂带交叉部位的西部。岩性为灰黑、土黄色页岩，粉砂质页岩（有的变质为褐黄色板岩）和灰、灰黑色粉砂岩、砂岩互层，有时亦夹砾岩和煤线，底部为砾岩。