琼州府是中国明初时期在海南设立的地方行政机构，隶属广东省，南海诸岛被划归琼州府领属的万州管辖，琼州府治琼山县（治所在今海南琼山府城镇）。

琼是海南省的简称，源于海南原为琼州府。隋朝时，在海南岛设临振、珠崖两郡。唐代，在海南设崖州、儋州、振州、万州、琼州五个州.。南宋时将南海诸岛及其海域归万安州管辖，正式对其行使主权，设一州和三个军，琼州领五县，南宁军领三县，万安军领二县，吉阳军领三镇。在元代，海南建制多仿宋代，无大变更。元代至治元年(1321年)，文宗图帖睦尔以亲王身份被贬居海南3年，回京 (1328年)后，曾将设立不久的定安县升格为南建州。明初，琼州升格为琼州府，辖儋州、崖州、万州三州13县，并将南海诸岛改归崖州管辖。清代表基本沿袭明制。

从琼州府这一地方行政机构设置可以看到中国对南海的行政管辖权早在中国古代就已经拥有，南海诸岛早在中国古代就在行使管辖权，那时的南海诸岛已经是中国领土。

（施鹤群）