平行志愿的投档原则是 “ 分数优先，遵循志愿 ” 。在对某个批次投档时，计算机投档系统首先对文科或理科考生由高到低排序，文科一个队伍，理科一个队伍。然后再依次检索考生所填报的 ABCD 四个高校志愿，只要考生填报的高校中出现符合投档条件的高校，即将该考生的档案放到该高校。等所有考生的档案全部检索完毕，一次性投档，填报相同高校最终排序并列的所有考生档案都投出。

意思就是，如果你填的4个学校中，第一个就拿了你的档，你的档就不可能到志愿2的学校。不是4个学校都能拿你的档的。

即使你不想去志愿1的学校，但是由于你的档案已经投出，不可能再取回放到志愿2的学校。

如果你被投档后，（还在模拟投档期间）不去志愿1的学校，你的档就被自动送如下一阶段，就是说你报一本A类的学校，但是被退了档，就不能再进入志愿2的学校，只能在一本A录完后等补录或者是等一本B的录取。

平行志愿不是平等志愿，它是按照A到D（部分省区有E志愿）的方式进行检索，所以好学校要填前面，次一点放在后面。

因此，由于部分高校出于名声的考虑、鼓励考生填报该校，对AB位置填报的考生在选专业的时候有照顾，所以平行志愿中高校的顺序虽然对投档没任何问题，但是在选专业时却会有一定的影响。