内蒙古大学计算机学院成立于1997年，其前身是1978年设置的计算机专业和1988年成立的计算机科学系。内蒙古大学软件学院成立于2005年，与计算机学院为一个实体，两个牌子。学院由计算机科学系、软件工程系、信息管理系和计算（实验）中心等教学科研单位组成。设有计算机科学与技术、信息管理与信息系统、电子商务、计算机科学与技术（软件工程）4个本科专业与方向。学院目前在校本科生800余人，硕士研究生140余人，工程硕士140余人，博士生7人。

学院有一个博士学位授权点，一个计算机科学与技术一级学科硕士学位授权点，一个管理学二级学科硕士学位授权点，两个工程硕士授权点。其中教授以李华、段禅伦较为出名。