南山禅寺前身是黄县境内（今龙口市）最古老最著名禅寺-石泉寺，据《县志》记载：佛教唐时传入，“自唐至清、佛教兴盛，全县800余村，村必有庙。境内城西南（今南山）石泉寺最古老，创建于唐贞观年间。”

1999年为发展旅游业，对石泉寺进行重修，改名为“南山禅寺”，重修后的南山禅寺复旧貌，换新颜，整体建筑气势宏伟，占地４万平方米，建筑面积9800平方米。进入山门中路有弥勒殿、大雄宝殿、圆通殿、藏经阁；东路有钟楼、地藏殿、伽蓝殿、东方三圣殿、菩提殿、文殊殿；西路有鼓楼、祖师殿、

西方三圣殿、普贤殿。