马祖民俗文物馆坐落在清水村胜利水库旁，在馆前罗列有四座雾炮，虽然年代久远却保存良好。该炮座是由东莒岛移来至此，原是配合东莒灯塔，逢浓雾或视线不清时，辅助指引的功用，以引导海上渔船。还有闽浙总督告示石牌，却因长年受风吹雨打而字迹多模糊难辨。

馆内分为民俗厅、景文厅、振武厅、怀怀厅四大展示区，民俗厅及景文厅陈列历代马祖的文化遗产，如服饰、器皿、古币、古花轿等；振武厅以图文资料展示马祖历史沿革；怀德厅陈列各级长官莅马巡视的纪录。从这些马祖昔日的各项生活器物、老照片中，可更进一步了解马祖人的生活方式！

馆外是传统闽东造型和颜色，馆内三层，典藏许多马祖文物，以及自然生态的介绍，还有文艺活动及演讲会场的设置。

文物馆外面还有代表马祖神话之鸟的燕鸥雕刻，还有趣味盎然的十二生肖石雕，展览在户外广场。