吕琨 字瑶甫 号星石。清初山东文登县吕家集人。1669年（康熙八年）中举人。1682年（康熙二十一年）中进士，名列三甲第五十五名，最高官至监察御史（一品，清代首席监察官）。

吕琨为南宁县知县时，南宁县刚经历战乱和水旱灾害，民生凋敝、百姓穷困。吕琨到任后，粗茶淡饭，粗布衣衫，与百姓同甘共苦。在任五年，革除县衙内陈规陋习，消除社会危害，南宁面貌焕然一新。

此后升任御史大夫，大胆向朝廷建言。后历任通政司右通政史、监察御史。

吕琨著述较多，主要作品有《山东草》、《滇游草》、《燕邸草》。有《星石奏议》一卷。

吕琨的后裔有许多名人，以诗名闻于世居多。